在面臨社會環境的變遷，漁會的組織架構仍有待加強，為迎合時勢求新、求變的汰弱留強之生存觀念。因此，服務漁民的精神是以達到精、簡、速的三原則為目標，使漁民認同漁會的存在價值與服務漁民的使命感。漁會未來的經營方針，將朝下述方向執行：
■ 加強漁業資源保護工作
確保漁業資源豐富，才能讓漁民有生財之道得以維生，提昇其生活品質。且可以讓漁業資源得以生生不息，維護海底世界的共生共存食物鏈原理，以使漁業資源無所匱乏。
■ 落實漁村推廣教育工作
除強化漁民生產技術的培訓外，更加強漁村婦女家庭管理及營養保健教育，落實漁村青少年四健活動的執行，以改善漁家的生活環境與面對環境多角化的適應力，增進漁民對本會的認同感與向心力，建立漁會新形象。
■ 改善產銷管道工作
除了加強魚市場的經營管理方式，減少場外交易情況，以改善魚市場的虧損情形；並藉由直銷中心的經營方式，讓漁民直接將其生產、加工或捕撈的漁產品賣給消費者，減少中間商不當的剝削，增加漁友的收益。並提供漁友相關的產銷資訊，以減少大家一窩蜂的養殖心態，避免供過於求的狀況，造成量多價賤的慘狀，而使漁民損失不眥。尤其布袋、東石沿海養殖牡蠣漁友甚多，每逢颱風季節來不及收成的損失情形嚴重，或是盛產期時，因無多管道的產銷制度，致使蚵民常血本無歸，所以改善漁產品的產銷管道是當務之急。
■ 強化信用部金融業務的工作
改善員工服務的品質，加強信用金融業務多角化服務項目，以迎合現今多變社會的競爭力，並設法降低逾放比例，以強化信用部的財務結構，改善漁會收入情形。
本會轄屬各區漁民的漁業作業方式各有不同，有的以養殖為生，有的以海上漁撈作業為主，無論其從事的是何種漁業類型，漁民均需漁會為其服務的範圍有供銷、推廣、金融、保險等相關的工作，本會仍一本初衷盡其所能服務漁友。
面臨經濟不景氣，漁業資源的日漸枯萎，金融事業的經營困難，現經營狀況遇到瓶頸，有待突破的有：
一、產銷問題：極力爭取上級的補助設立直銷中心，以減少中間商的價差剝削，增加漁友收益。
二、信用部業務經營問題：面對金融自由競爭的情形，漁民漁業收入欠豐的情況下，無法償還貸款，造成漁會信用部的經營困難。所以漁會現階段經營體系仍有待政府輔導改善。
▲嘉義區漁會現址
民國十四年十一月六日，台南州東石郡東石庄地區漁民，依據民國十三年台灣總督府頒布之漁業組合令，成立「保證責任東石庄漁業協同組合」，會址在東石庄頂東石157。同年十一月廿六日，布袋庄漁民也設立「有限責任布袋庄漁業協同組合」，會址在東石郡布袋庄布袋82。民國三十三年依水產業團體法，將漁業組合改為水產業會。
光復後歷經兩次改組，民國四十四年四月頒布「台灣省各級漁會改進辦法」，將漁會由三級制改為二級制，嘉義縣布袋鎮漁會轄區內，由布袋鎮漁會劃出新塭地區養殖漁民成立新塭區漁會，會址在布袋鎮新民路292號。義竹地區養殖漁民也申請成立義竹區漁會，會址在義竹鄉北華村20號。由是嘉義縣轄區內計有東石、布袋、新塭、義竹等四區漁會。
民國六十四年十二月漁會法修正公布，各級漁會自六十五年二月實施合併改選，四月嘉義縣奉命將原東石、布袋、新塭、義竹四區漁會合併，九月一日正式成立嘉義區漁會，會址設在朴子鎮魚市場二樓，同時分別在東石、布袋、新塭、義竹等地設立辦事處。民國六十六年始將區漁會辦公處遷至布袋鎮興中里現址。
